После раздела дома и образования 2-ух отдельных помещений в описанном случае необходимо было снять его с кадастрового учета и зарегистрировать прекращение прав на начальный жилой дом. В данной ситуации делается реконструкция, в итоге которой создается "жилой дом блокированной стройки", также разделяются земляные участки.
Ежели этого изготовлено не было, то регистратор действовал в рамках закона.
На данный момент можно произвести раздел собственниками земляного участка под домом, приготовить межевой план и подать поновой раздельно каждому собственнику документы по "Дачной амнистии".